毛賀は木造の待合室とトイレが付いただけの片面ホームの駅。ホームの入口付近に駐輪場がある。
駅の前には中学校、駅の裏の高台には国道151号線が走っているので駅前の道路は国道へ出るための車が多く通っている。
朝の毛賀は飯田方面への通学客が多い駅であった。